Astăzi, oamenii care doresc să vândă bunuri (sau să-și miște oamenii) sunt de natură să-și dea seama că nu are întotdeauna sens să rămânem la un singur mod de transport. De exemplu, încărcătura poate fi descărcată dintr-o navă pe un camion, care o transferă într-un railoard, de unde va fi mutat în țară cu trenul. Transportul intermodal poate fi mai eficient și mai ieftin; în unele cazuri, totuși, are dezavantaje pronunțate în ceea ce privește viteza și fiabilitatea.
Viteză
Deși transportul intermodal oferă avantajul unor costuri relativ scăzute în comparație cu alte metode, acesta obține acest lucru prin sacrificarea vitezei; în orice moment, încărcătura este transferată într-un mijloc de transport relativ mai lent, de exemplu trenurile care operează pe șine fixe care nu pot oferi calea directă pe care drumurile un camion le utilizează, aceasta încetinește. Pentru a funcționa la o eficiență maximă, transportul intermodal trebuie, de asemenea, să reducă timpul petrecut în depozite pentru a ajunge la un nou transportator sau pentru a descărca încărcătura.
Lipsa fiabilității
Datorită dependenței de mai multe modalități de tranzit, transportul intermodal este, de asemenea, supus unei creșteri globale a fiabilității; pe măsură ce lanțul diferitelor moduri crește, posibilitatea creșterii oricăror legături în lanț se înmulțește. Acest lucru este deosebit de dificil atunci când unul dintre modurile de transport este feroviar; căile ferate sunt mai susceptibile la întârzieri introduse de vreme rea sau de eșecul echipamentului. Din acest motiv, precum și preocupările legate de viteză, expeditorii care necesită un transport fiabil și rapid de transport sunt mai puțin susceptibili să ia în considerare sistemele intermodale.
Deteriora
Ori de câte ori încărcătura trebuie amestecată, expeditorii riscă să se deterioreze, deoarece mărfurile sunt transferate de la o metodă de transport la alta. Din fericire, acest pericol poate fi atenuat, dar, în general, acest lucru implică supraaglomerarea prin adăugarea unui material mai rezistent și mai protector decât ar fi considerat în mod normal suficient. Această greutate adăugată și cheltuielile parțial contracarează avantajele transportului intermodal în ceea ce privește eficiența energetică și costul.
Costuri ridicate ale infrastructurii
Transportul intermodal de marfă prezintă, de asemenea, costuri de infrastructură relativ ridicate. Containerizarea a redus costul și dificultatea transportului de mărfuri prin standardizarea formei lor; expeditorii pot muta cu ușurință același container dintr-o navă într-un tren către un camion. Cu toate acestea, manipularea acestor containere necesită ca expeditorii să aibă macaralele grele și echipamentul necesar pentru manipularea containerelor mari; această infrastructură ar putea să nu existe în toate locurile, în special în țările în curs de dezvoltare.